BioSimSpace.Process.Gromacs
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.. currentmodule:: BioSimSpace.Process

.. autoclass:: Gromacs

   
   .. automethod:: __init__

   
   .. rubric:: Methods

   .. autosummary::
   
      ~Gromacs.__init__
      ~Gromacs.addArgs
      ~Gromacs.addToConfig
      ~Gromacs.clearArgs
      ~Gromacs.command
      ~Gromacs.deleteArg
      ~Gromacs.exe
      ~Gromacs.getAngleEnergy
      ~Gromacs.getArgString
      ~Gromacs.getArgStringList
      ~Gromacs.getArgs
      ~Gromacs.getBondEnergy
      ~Gromacs.getConfig
      ~Gromacs.getConservedEnergy
      ~Gromacs.getConstraintRMSD
      ~Gromacs.getCoulomb14
      ~Gromacs.getCoulombReciprocal
      ~Gromacs.getCoulombSR
      ~Gromacs.getCurrentAngleEnergy
      ~Gromacs.getCurrentBondEnergy
      ~Gromacs.getCurrentConservedEnergy
      ~Gromacs.getCurrentConstraintRMSD
      ~Gromacs.getCurrentCoulomb14
      ~Gromacs.getCurrentCoulombReciprocal
      ~Gromacs.getCurrentCoulombSR
      ~Gromacs.getCurrentDihedralEnergy
      ~Gromacs.getCurrentDispersionCorrection
      ~Gromacs.getCurrentImproperEnergy
      ~Gromacs.getCurrentKineticEnergy
      ~Gromacs.getCurrentLennardJones14
      ~Gromacs.getCurrentLennardJonesSR
      ~Gromacs.getCurrentPotentialEnergy
      ~Gromacs.getCurrentPressure
      ~Gromacs.getCurrentPressureDC
      ~Gromacs.getCurrentProperEnergy
      ~Gromacs.getCurrentRecord
      ~Gromacs.getCurrentRecords
      ~Gromacs.getCurrentRestraintEnergy
      ~Gromacs.getCurrentStep
      ~Gromacs.getCurrentSystem
      ~Gromacs.getCurrentTemperature
      ~Gromacs.getCurrentTime
      ~Gromacs.getCurrentTotalEnergy
      ~Gromacs.getDihedralEnergy
      ~Gromacs.getDispersionCorrection
      ~Gromacs.getFrame
      ~Gromacs.getImproperEnergy
      ~Gromacs.getInput
      ~Gromacs.getKineticEnergy
      ~Gromacs.getLennardJones14
      ~Gromacs.getLennardJonesSR
      ~Gromacs.getName
      ~Gromacs.getOutput
      ~Gromacs.getPackageName
      ~Gromacs.getPotentialEnergy
      ~Gromacs.getPressure
      ~Gromacs.getPressureDC
      ~Gromacs.getProperEnergy
      ~Gromacs.getRecord
      ~Gromacs.getRecords
      ~Gromacs.getRestraintEnergy
      ~Gromacs.getSeed
      ~Gromacs.getStderr
      ~Gromacs.getStdout
      ~Gromacs.getStep
      ~Gromacs.getSystem
      ~Gromacs.getTemperature
      ~Gromacs.getTime
      ~Gromacs.getTotalEnergy
      ~Gromacs.getTrajectory
      ~Gromacs.inputFiles
      ~Gromacs.insertArg
      ~Gromacs.isError
      ~Gromacs.isQueued
      ~Gromacs.isRunning
      ~Gromacs.kill
      ~Gromacs.resetArgs
      ~Gromacs.resetConfig
      ~Gromacs.run
      ~Gromacs.runTime
      ~Gromacs.setArg
      ~Gromacs.setArgs
      ~Gromacs.setConfig
      ~Gromacs.setName
      ~Gromacs.setSeed
      ~Gromacs.start
      ~Gromacs.stderr
      ~Gromacs.stdout
      ~Gromacs.wait
      ~Gromacs.workDir
      ~Gromacs.writeConfig